Общественная организация «Международная академия технологических наук» учреждена в 1991 году на Общем собрании в городе Москве и зарегистрирована Министерством юстиции СССР 04 июня 1991 года.

Создание Академии было инициировано российской делегацией во главе с Алфеевым Владимиром Николаевичем (первым Президентом МАТН) на международной конференции по нанотехнологии, которая проходила в апреле 1991 года в г. Интерлакен (Швейцария). Данное предложение нашло поддержку со стороны представителей США, Германии, Франции, Швейцарии, Италии, Австрии и других стран, принимавших участие в конференции.

Учредителями МАТН являются Академия технологических наук Российской Федерации (АТН РФ) совместно с Российско-Американской Академией технологических наук и Международной Ассоциацией «Новые высокие технологии».

В ноябре 1992 года на 10-ой сессии Совета по промышленному развитию Организации Объединенных наций (ЮНИДО) МАТН получила консультативный статус при этой Международной организации.

Основатель Академии – Владимир Николаевич Алфеев в 1988-1989 гг. обосновал необходимость формирования новой области знаний по развитию высоких (инновационных) промышленных технологий, которую предложил назвать «технологические науки».